HSV-2的生物信息学分析及其探针设计的探讨

来源 :山西医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xby520

【摘要】

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目的利用生物信息学分析单纯疱疹病毒2型（HSV-2）基因序列的特点,设计HSV-2诊断芯片的Oligo探针。方法利用Matlab7.0和ANTHEPROTV5对HSV-2序列进行分析,并通过BLAST软件对HSV-2

【作者】

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张建华王海涛张芳琳

【机构】

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郑州大学生物医学工程系,第四军医大学基础部微生物教研室

【出处】

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山西医科大学学报

【发表日期】

：

2008年7期

【关键词】

：

单纯疱疹病毒2型 MATLAB7.0 BLAST Oligo探针 HSV-2 Matlab7.0 BLAST oligonucleotide probe

【基金项目】

：

河南省自然科学计划基金资助项目（2008A310019）

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目的利用生物信息学分析单纯疱疹病毒2型（HSV-2）基因序列的特点,设计HSV-2诊断芯片的Oligo探针。方法利用Matlab7.0和ANTHEPROTV5对HSV-2序列进行分析,并通过BLAST软件对HSV-2的DNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;用生物学软件Oligo6.0设计特异性高、Tm值相近、长度均一的Oligo探针。结果利用Matlab7.0和ANTHEPROTV5分析HSV-2二级结构的分布以及其理化性质,同时生物学软件Oligo6.0获得13条60-merOligo探针。结论

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