秦岭造山带主要由三大套构造岩石地层单元组成，经历了三个主要演化阶段：1．前寒武纪古老基底形成演化阶段，2．主造山期（Pt3—T2）板块构造演化阶段，3．中新生代陆内构造演化阶段。在早中元古代以扩张构造体制占主导，形成裂谷与小洋盆兼杂并存的基本构造格局，经10—8亿年晋宁期从扩张垂向加积增生构造体制为主向以侧向增生为主的板块构造体制的过渡，于晚元古代中晚期开始进入板块构造演化阶段。在晚古生代早期由于东古特提斯洋的形成，扬子板块北缘沿秦岭南部扩张打开，形成华北板块、扬子板块及其间的秦岭微板块，沿商丹和勉略二缝合带自南向北俯冲消减碰撞，于中三叠世最后全面陆陆碰撞造山，而后又发生了强烈陆内造山作用，终成今日之秦岭山脉面貌。现今的秦岭造山带岩石圈结构是一正在调整演化中的具流变学分层的“立交桥式”三维结构，上部地壳呈多层逆冲推覆迭置的不对称扇形几何学模式，岩石圈中部则是成水平状流变层，而深部地幔则是最新调整的近南北向的地球物理异常状态与结构，形成从下到上构造方向近乎正交的圈层非耦合关系。