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公立医疗卫生机构改革是我国深化医药卫生体制改革的重点和难点，加强其绩效考核是推进改革的重要抓手。笔者通过对比分析2019年以来我国三级公立医院、二级公立医院和基层医疗卫生机构绩效考核政策文件，梳理3个考核指标体系的异同和规律，分析其对医疗卫生机构管理的影响，为完善绩效考核工作提供参考。3个政策均希望通过绩效考核指标引导各级医疗机构加强运营管理和人才培养以实现可持续发展；主要引导三级公立医院由规模扩张型转向质量效益型，引导二级公立医院大力提升医疗服务能力，引导基层医疗卫生机构做好基本医疗和公共卫生服务。但对二级公立医院的考核缺乏分级诊疗相关指标和对考核结果的运用，基层医疗卫生机构考核指标中国家监测指标占比仅为23.8%，增加了基层填报压力。今后应动态调整并持续完善绩效考核指标体系及监测方法，强化考核结果的运用和配套政策制定。