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使用2015年我国31个省市自治区的面板数据，首先分别运用DEA、SFA、因子分析对31个省市自治区的产学研协同创新的效率进行评价，然后运用TOPSIS法将三种方法的效率值综合得到31个省市自治区的产学研协同创新效率，最后运用多元回归模型实证研究产学研协同创新主要创新主体的投入对其效率的影响。结果表明：企业投入、高校投入、政府过度投入与产学研协同创新效率正相关，而政府一般投入与产学研协同创新效率负相关，科研机构投入对产学研协同创新效率的影响并不显著。