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采用一种信息离散性度量方法对CB396数据集中的蛋白质数据进行二级结构预测，预测准确率达到72．1％．为了提高预测准确率，将FDOD算法结合PSI—BLAST进行多重序列比对，使预测准确率提高到75．6％，证明了该方法的有效性．在此基础上，利用20种疏水标度改进FDOD方法，以减小计算量．最后，结合长程作用，对预测准确性的影响因素进行了讨论．