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分子进化中性学说认为生物的进化主要是由中性突变决定的．基因表达式编程（GEP）是一种将基因型和表现型分离的新的进化模型，其突出表现在基因组存在不被表达的中性区．基于朴素基因表达式编程（NGEP）模型研究了NGEP中性区在进化中的作用．主要工作包括：1）进一步完善了基于完全树编码方案的NGEP模型的概念；2）分析了传统GEP和NGEP的基因中性区域特点，指出NGEP存在更自由灵活的中性区域；3）通过控制基因长度和基因数量，调控中性区的大小和数量，研究了NGEP和传统GEP的中性区域在进化中的特殊作用，验证了