甘蓝型油菜PDR基因家族鉴定及系统进化分析

来源 :植物生理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:menghong1882
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PDR基因家族是ABC基因家族中的一个亚家族,在植物响应非生物胁迫的过程中具有重要作用。本研究通过全基因组分析鉴定了甘蓝型油菜(Brassica napus) BnaPDR基因家族成员,对其进行理化性质、基因结构、进化关系、共线性等生物信息学分析,并检测了BnaPDR5基因在盐、旱胁迫诱导下的表达情况。结果表明:在甘蓝型油菜基因组共鉴定到49个BnaPDR基因,划分为5个亚族,亲缘性相近的基因家族成员具有类似的基因结构和保守基序,且含多种与激素和非生物胁迫响应相关的顺式作用元件。对甘蓝型油菜、白菜(B. rapa)、甘蓝(B. oleracea)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)的共线性分析表明,甘蓝型油菜在进化过程中出现了基因丢失现象。选择压力分析表明, BnaPDR基因家族在芸薹属物种间的进化相对保守。基于公开报道的甘蓝型油菜盐、旱胁迫转录组数据进行了BnaPDR基因表达分析,结果表明甘蓝型油菜PDR基因可能与油菜响应盐、旱胁迫有关。重点分析了BnaPDR5基因在盐、旱胁迫下的表达模式,结果显示BnaPDR5基因在盐、旱胁迫的甘蓝型油菜中均表达上调,进一步表明BnaPDR5基因在油菜响应盐、旱胁迫的过程中发挥重要作用。
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