特定的异姓家族不通婚多是源自历史上的人为因素，但是同姓之间不通婚的习俗却从中国最早的婚姻制度诞生起就有了。
　　吕思勉在《中国制度史》中说：中国的婚姻制度，经历过原始群婚、血缘婚、亚血缘婚、对偶婚和专偶婚等多个阶段。而在群婚时代，人们没有父母、兄弟姐妹的概念，两性关系纯粹出于“自然”。而所造成的乱婚、抢婚等习俗，就极易导致社会不稳定。
　　这种“自然”状态的结束，要归功于伏羲氏。据《竹书纪年》记载，约6000年前，伏羲氏在平定天下之后，首先完成了的两件事就是“正姓氏、制嫁娶”。所以说，姓氏和嫁娶制度几乎是在同时被确立下来的。
　　伏羲氏所确立的，也是被认为最早的婚姻法中就有规定：在同一氏族内，亲亲不准婚配。而正姓氏的具体规定有：同姓之间不通婚。至此，中华民族才算摆脱了蒙昧的“自然”群婚状态，迈向文明。
　　但是姓氏发展下去，又产生了分化。比如秦国的祖先姓嬴，他的后代被分封到各地，于是有了徐、江、赵等不同的姓。由于血缘相近，通婚可能导致生育后代素质降低，所以虽然不是同姓，在一些时代和地区，也有不通婚的禁忌。
　　而在北方各民族中，几乎也都秉持着“同姓可结交，异姓可结婚”的传统。以蒙古族为例，古代全蒙古各部王公，均为成吉思汗家族后裔，在民俗传统中有“同姓是同骨，同骨不通婚”的禁忌。因此，蒙古贵族之间通婚，只能在血缘很远的其他贵族之间进行。
　　其实，关于同姓能否结婚，核心考慮的还是血缘因素。在那个人际圈还很狭窄，人类的脚步还没有踏遍世界的年代，禁止同姓通婚，也是一种优生的措施。如今，同姓通婚早已不是禁忌了。