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目的
构建可定制化的病原菌及耐药基因快速检测芯片,探索建立基于临床的外科感染病原菌及耐药基因快速DNA芯片检测平台。
方法回顾性分析2008年1月1日至2011年12月31日北京大学人民医院7 893份外科感染标本的临床数据,确定检测芯片的目标菌株及耐药基因,研制定制化病原菌及耐药基因快速检测芯片,并检测其敏感度、灵敏度和特异度,然后初步应用定制化芯片检测临床标本,评价其效用。
结果建立了基于医院病原菌谱的、可同时检测10种细菌和13种耐药基因的检测芯片,灵敏度与普通PCR相当,且与培养鉴定及基因测序鉴定比较,基因芯片检测均表现较高的特异性(93.5~100)%及灵敏度(76.4~100)%,同时对耐药基因检测与基因测序相比,差异无统计学意义,基因芯片检测时间(8.68±0.39)h明显少于传统检验方法(P<0.05)。
结论基于医院病原菌谱的定制化芯片构建方法完全可行,其快速、准确获得感染病原菌信息对于外科感染治疗具有十分重要的意义。