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高等真核生物基因组的isochore结构与许多重要的生物学特征相关，而对其边界的确定则是isochore结构分析的重点，同时也是难点．针对基于Z曲线的累积GC轮廓图法、基于Shannon熵的递归分段算法以及基于二次散度的分段算法三种典型的应用，分析出其分段依据本质上是对于基因组序列求取碱基对换对称性的对称中心．基于此结果，在寻找isochore结构分析度量时，只要度量函数满足一定对换对称性要求，即可达到殊途同归的目的．