【目的】研究日本农协和批发市场在日本农产品流通体系中的重要作用及其之间的关系,剖析其形成原因,为探索和构建我国公平高效的农产品流通体系提供参考。【方法】对日本农协和批发市场在日本农产品流通体系中的地位和作用特征归纳总结,整理分析日本各官方机构的相关统计数据,并结合对日本农协和批发市场的实际调研情况,剖析两者之间在制度及在面对流通环境变化等方面的关系。【结果】在日本农产品流通体系中,农协指导生产并维护农民利益,批发市场的存在则保证了农产品交易的高效与公平,它们之间相互制衡,共同维持着日本农产品流通体系公正高效运行。农协合并后单位农协出货量大规模化导致农产品流通量向大规模批发市场集中,使大型化后的农协市场对话权明显加强;而农协市场对话力的加强和销售战略的改变是批发市场经营低迷的重要原因。【建议】我国应积极提升农村合作社的规模和实力,推进农产品批发市场体系的完善,同时应不断顺应环境变化对政策体系做出相应调整,以达到权利合理分配、保护流通中各主体利益的目的,保证流通体系高效平稳地运转。