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目的了解我国百日咳疫苗生产株百日咳毒素S1和外膜蛋白(Prn)的基因特征.方法分别克隆疫苗株的S1和Prn基因至PGEM-T easy载体、进行测序,并与GenBank中收录的百日咳杆菌S1和Prn蛋白基因序列进行比较、分析.结果完成了3株疫苗生产株S1和Prn基因的扩增、克隆和序列测定.序列分析显示3疫苗株间的S1和Prn基因核苷酸序列和氨基酸序列同源性均在99%以上,基因进化树显示与其他菌株的同源性也较高.结论对我国3株疫苗生产株S1和Prn基因序列进行了详细地分析,为我国百日咳流行病学的研究和疫苗的质量控制、研制奠定了基础.