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[目的]阐明XML在生物信息学研究中的重要地位与作用。[方法]通过详细阐述XML的基本原理，系统地比较和分析XML与其他应用于生物数据管理的标记语言包括HTML、BSML、BioML等的利与弊，以期阐明XML作为一种数据语言在生物信息学中的重要作用。[结果]XML是一个很有前途的扩展性标准语言，是生物信息学数据库内部数据交换的重要枢纽。[结论]XML是用于生物信息学的各个领域中生物数据管理最有效的标记语言。