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单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是第三代遗传标记,在基因定位、遗传疾病等研究中发挥着重要作用.随着SNP检测技术的发展,在大规模人群中研究全基因组的变异位点与复杂疾病的关系已经成为可能.文章系统地介绍了全基因组关联研究(whole genome association,GWA)中所采用的几种高通量的SNP检测技术、原理、基因芯片及其商品信息,并对SNP技术在GWA研究中亟待解决的问题进行了阐述.