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小型水利工程数量多、结构灵活,适用于小型水体条件。部分小型水利工程设施的建设与运作,容易导致生态链断裂、水陆分隔等问题,且问题具有一定的衍生性,如果处理不及时负面影响会愈演愈烈。文章在分析小型水利工程导致的生态链断裂、生物习性路径阻隔、生物居所环境破坏、水陆渗水通道隔绝等问题基础上,对生态水利设计要点进行了分析。