以8个不同地区秦艽的干燥根为试验材料,以Alltech Chrom BDS-C18色谱柱(4.6mm×150mm,5μm)为色谱柱,乙腈—0.1%醋酸溶液(9∶91)为流动相进行等度洗脱,检测波长254nm;柱温30℃,进样量10μL。通过中药色谱指纹图谱相似度评价系统(国家药典委员会)进行相似度分析,建立8个不同产地的秦艽指纹图谱。以宁夏六盘山区所产秦艽为例,通过高效液相色谱法,以龙胆苦苷、马钱苷酸2个主要成分为主要因素,分析适宜秦艽有效成分积累的最佳立地条件,为建立秦艽质量标准、选择最佳生长条件提供理论依据。结果表明:1)8个不同产地秦艽指纹图谱共有6个主要共有峰,可作为鉴别秦艽药材的主要依据。2)8个不同地区秦艽药材聚类分析可分为4类:内蒙古海拉尔和山西阳泉的秦艽药材为一类,青海同仁和内蒙古通辽的为一类,河北张家口和陕西太白的为一类,云南洱源和宁夏六盘山的为一类。3)通过对宁夏六盘山区不同的秦艽生长立地条件的探究,有效成分积累量最高为阳坡,最低为半阴坡。