基于小麦淀粉合成酶SSⅡa氨基酸序列的生物进化分析

来源 :石河子大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangzzhenhua
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选取小麦淀粉合成关键酶SSⅡa,通过生物信息学分析,探究其在进化过程中与其它生物的亲缘关系,看其是否可以作为生物进化的依据。利用克隆得到的小麦SsⅡa基因翻译氨基酸序列,并在NCBI上做BLAsT同源比对,并于SwissProt非冗余蛋白数据库获得不同生物的同源氨基酸序列进行生物信息学分析。共比较了47种生物的氨基酸序列,其中包括6种藻类、1种苔藓、1种蕨类、1种菌类和38种陆生被子植物。结果显示:小麦淀粉合成酶氨基酸序列与其它生物的同源性为37%-99%,并表现出较高的保守性。通过构建系统进化树,发现淀
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