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目的了解手足口病患儿不同标本中病原检出情况,为手足口病的综合防治和肠道病毒的动态监测提供依据。方法2011年4月-8月,收集昆明地区73例手足口病患儿的咽拭子标本73份,疱疹液标本10份。采用实时荧光定量PCR方法进行CoxAl6和EV71病毒核酸的定性和定量检测;并随机抽取3份EV71阳性标本进行VP1基因节段的双向扩增,测定和分析核苷酸序列,并与GenBank中的EV71参考毒株进行比较,依据VPl片段构建基因亲缘性关系树;同时收集患儿的临床流行病学资料,进行临床特征分析。结果73份咽拭子标本中检出阳