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近年来饲料中的致病病原微生物种类日益复杂，波及原料种类范围更加广泛，而且耐药性不断增强。这些微生物对动物以及人类的健康造成越来越严重的威胁。一般的检测手段在这些致病菌的监测上比较吃力，但分子生物学技术的迅速发展，对病原微生物的鉴定不再局限于外部形态结构及生理特性等一般的检验，而是立足于分子水平，特别是核酸水平的检测，检测效率和灵敏度大大提高。