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目的：分析黄连温胆汤联合吴茱萸穴位贴敷治疗对脑卒中后睡眠障碍患者的临床效果。方法：收集本院2019年1月～2020年11月收治的88例脑卒中后睡眠障碍患者的临床资料。根据不同治疗方法分为对照组（n=42例，右佐匹克隆）与研究组（n=46例，黄连温胆汤剂联合吴茱萸穴位贴敷）,比较两组临床疗效、匹兹堡睡眠质量指数（Pittsburgh Sleep Quality Index, PQSI）评分、汉密尔顿焦虑（Hamilton Anxiety, HAMA）评分、汉密尔顿抑郁（Hamilton Depression, HAMD）评分、中医证候积分、血清脑源性神经营养因子（Brain-derived Neurotrophic Factor, BDNF）与5-羟色胺水平、生活质量及不良反应发生情况。结果：研究组治疗后总有效率为93.48%,显著高于对照组的78.57%（P<0.05）。治疗后，两组PQSI、HAMA、HAMD评分、中医证候积分及ADL评分均较治疗前降低，且研究组降低程度显著优于对照组（P<0.05）。两组治疗后MBL评分、BDNF及5-羟色胺水平均较治疗前上升，以研究组上升更为显著（P<0.05）。两组不良反应发生率比较差异无统计学意义（P>0.05）。结论：黄连温胆汤剂联合吴茱萸穴位贴敷治疗脑卒中后睡眠障碍患者疗效确切，可改善患者中医证候、提高睡眠质量，缓解焦虑及抑郁情绪，进而改善患者生活质量，安全可靠。