改进型基因集测试在乳腺癌研究中的应用

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yuggmacc

【摘要】

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乳腺癌是一种异源性疾病，包括至少5到6种分子亚型．在正常乳腺细胞中寻找不同癌症亚型的细胞起源非常重要，但很难做到。基因集测试（Genesettest）是处理微列阵（mieroarray）数据的常用

【作者】

：

吴迪王瓞

【机构】

：

澳大利亚威亥医学研究所,澳大利亚墨尔本大学,澳大利亚莫纳什大学莫纳什医学研究所,美国哈佛大学统计系

【出处】

：

生物信息学

【发表日期】

：

2012年2期

【关键词】

：

基因集测试乳腺癌基底型鲁米那前体细胞微列阵 Gene set tests basal -like breast cancer luminal pro

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乳腺癌是一种异源性疾病，包括至少5到6种分子亚型．在正常乳腺细胞中寻找不同癌症亚型的细胞起源非常重要，但很难做到。基因集测试（Genesettest）是处理微列阵（mieroarray）数据的常用生物统计方法，包括传统型和通用型。通用型基因集测试又分为竞争型和自含型。墨尔本大学的科学家用改进的基因集测试：修正竞争型测试（CAMERA）和旋转基因集测试（ROAST）的方法分析了乳腺癌亚型与乳腺细胞间的对应相似性，发现正常内腔鲁米那前体细胞很可能是基底型乳腺癌的细胞来源。此项研究成为澳大利亚年度生物医学的重大

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