基于Cygwin实现生物信息学软件从Unix/Linux向Windows移植

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：suzhouxyz

【摘要】

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Cygwin可在Windows环境下提供对Unix/Linux环境的模拟与支持,具有较为完善的Unix/Linux工具包和编程环境.利用Cygwin对常用的生物信息学数据分析软件如Sim4、FASTA、Phred/Ph

【作者】

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张成岗

【机构】

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军事医学科学院放射医学研究所

【出处】

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生物信息学

【发表日期】

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2003年1期

【关键词】

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CYGWIN UNIX/LINUX WINDOWS 生物信息学程序移植 Cygwin Unix/Linux Windows bioinformatics

【基金项目】

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国家重点基础研究发展计划(973计划)，国家高技术研究发展计划(863计划)，国家海外青年学者合作研究基金，国家自然科学基金，国家自然科学基金，国家自然科学基金，北京市科技基金

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Cygwin可在Windows环境下提供对Unix/Linux环境的模拟与支持,具有较为完善的Unix/Linux工具包和编程环境.利用Cygwin对常用的生物信息学数据分析软件如Sim4、FASTA、Phred/Phrap/RepeatMasker、EMBOSS、HMMER和ClustalW等进行重新编译,发现通过该方式能够获得可在Windows环境下运行的可执行代码,为利用Windows环境优势的同时进行跨平台生物信息学数据分析平台的开发提供重要参考价值.

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