【摘 要】
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利用紫外光谱结合支持向量机（SVM）模式识别原理建立了短串联重复序列（STR）的分型方法。以D5S818基因座的10—10、11—13和13～13三个基因型为研究对象，优化了包含该多态性位点的DNA
【机 构】
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苏州大学医学部药学院,重庆科技学院化学化工学院
【基金项目】
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国家大学生创新性实验计划资助项目（57315425）
论文部分内容阅读
利用紫外光谱结合支持向量机（SVM）模式识别原理建立了短串联重复序列（STR）的分型方法。以D5S818基因座的10—10、11—13和13～13三个基因型为研究对象，优化了包含该多态性位点的DNA片段的聚合酶链反应（PCR）的扩增条件和紫外光谱检测条件，获得了优化条件下的待测样本紫外光谱。以该光谱为识别变量，建立了该3类基因型的SVM判别模型，有效地克服了光谱共线性，模型预测率100％。该方法无需任何检测前处理，只需一步PCR扩增和紫外光谱检测即可实现STR的基因分型，具有简单、快速、低成本等优点。
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