利用改进的cDNA RDA技术分离胡萝卜(Daucus carota L.)体细胞胚根发育相关的基因

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根据链霉亲和素与生物素之间的结合作用及磁性吸附分离的原理,发展出改进的cDNA代表性差式分析(representational difference analysis,RDA)技术,并用来检测在调控和解调控培养12h的胡萝卜体细胞胚中特异表达的基因.结果显示,在解调控12h的胡萝卜体细胞胚中,存在4条特异表达的cDNA片段,命名为NR-1,NR-2,NR-3和NR-4.将这些片段分别克隆在pBS噬菌粒载体中.DNA序列同源性比较表明,片段NR-3和NR-4分别与植物的DnaJ和木质葡聚糖内转糖基化酶(xyloglucan endo-transglycosylase)的编码基因有很高的同源性,而片段NR-2中有一段序列与LEA蛋白(late embryogenesis abundant proteins)基因有一定的同源性.NR-1则可能来自新基因.用32P标记NR-1作探针,与cDNA片段群体进行杂交证实,从解调控12h的胡萝卜体细胞胚中克隆到一种与胚根发育相关的新基因序列.Southern杂交表明,此基因在胡萝卜基因组中可能以单拷贝或低拷贝的形式存在.
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