论文部分内容阅读
目的
确定临床分离变形杆菌中不典型第1类整合子的结构。
方法在26株第1类整合酶基因阳性可变区扩增失败的变形杆菌临床分离株中，选取6株通过反向PCR扩增第1类整合酶基因周围DNA片段，PCR产物测序结果通过BLAST进行比对分析，确定同源目标序列后，查看GenBank该提取码对应序列文件靶序列周围序列，再根据周围序列设计合成引物进行重叠PCR并测序验证。
结果通过反向PCR及重叠PCR测序分析，26株变形杆菌临床分离株中，25株细菌第1类整合子可变区结构全部或部分确定，其中22株细菌第1类整合子可变区结构为estX-psp-aadA2-cmlA1-aadA1a-qacI-tnpA-sul3，另3株第1类整合子可变区分别为estX-psp-aadA2-cmlA1、dfrA14、IS26，均缺失3′保守区。
结论反向PCR可用于临床菌株中不典型第1类整合子结构分析，在临床分离变形杆菌中首次检出基因盒psp及基因盒组合estX-psp-aadA2-cmlA1-aadA1a-qacI-tnpA-sul3、estX-psp-aadA2-cmlA1。