油茶花发育转录组测序及相关基因表达分析

来源 :林业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liouxing1984
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通过对油茶成花过程的转录组测序及其成花相关基因的表达分析,结果表明:转录组测序总共获得28 448 847个reads,5 742 023 480 bp数据量,GC含量为46.52%;拼接成大于200 bp以上的Unigenes有94 476条,N50长度为806 bp,其中1 kbp以上的Unigenes共12 643条,占Unigene总数的13.38%;Unigenes在各数据库中功能注释数目,在COG中有9 095条,在GO中有27 201条,在KEGG中有6 431条,在Swissprot中有24 534条,在TrEMBL中有36 393条,在Nr中有36 400条,在Nt中有30 858条;茎尖中FLC,FCA和FT基因表达量较AP1,AP2和PI基因低,FT基因(ID:Unigene60063)是油茶成花的关键基因,PI基因(ID:Unigene56059)与雄蕊发育关系紧密。
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