【摘 要】
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目的 研究H9N2禽流感病毒进化规律,对其进化适应性进行分析。方法 筛选H9N2禽流感病毒完整全基因组序列,构建系统生成树,基于LBI算法根据系统生成树以及基因组序列所蕴含信息对H9N2禽流感病毒序列进行适应性分析,并运用TreeTime对H9N2禽流感病毒时空分布等信息进行系统动力学分析。结果 具有高适应性的H9N2禽流感病毒毒株分布于多个不同的支系中,除A/chicken/Shandong/H
【基金项目】
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国家自然科学基金(32070025,31800136;
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目的 研究H9N2禽流感病毒进化规律,对其进化适应性进行分析。方法 筛选H9N2禽流感病毒完整全基因组序列,构建系统生成树,基于LBI算法根据系统生成树以及基因组序列所蕴含信息对H9N2禽流感病毒序列进行适应性分析,并运用TreeTime对H9N2禽流感病毒时空分布等信息进行系统动力学分析。结果 具有高适应性的H9N2禽流感病毒毒株分布于多个不同的支系中,除A/chicken/Shandong/H/2009、A/chicken/Zhejiang/C3188/2010等毒株所在支系外,绝大部分高适应性毒株支系来自于2013-2014年的中国地区。PB2节段的高适应性支系时间分布集中于2013年前后,HA、PB2、MP节段高适应性支系地区分布相对集中,其余各节段时间分布跨度相对较大、地区分布广泛。结论 H9N2禽流感病毒在2013年前后变异速度的加快导致许多具有高适应性的毒株支系出现,大部分具有高适应性的毒株支系具备时间分布跨度大、地区分布范围广的特点。但如何依据H9N2禽流感病毒进化规律预测其未来发展方向,亟需更多研究予以解决。
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