不同荧光定量聚合酶链反应法基因检测肺炎链球菌的比较研究

来源 :中国医师进修杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:anran520
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目的 比较不同荧光定量聚合酶链反应法(PCR)基因检测肺炎链球菌的敏感性和特异性.方法 通过设计5种针对肺炎链球菌不同基因的引物[自溶素基因(lytA)、溶菌素基因(ply)、黏附基因(spn9802)、荚膜多糖生物形成蛋白基因(psaA)、编码DNA片段的基因(cspA)],采用荧光定量PCR检测37株肺炎链球菌、28株非肺炎链球菌以及80例临床痰液标本,评价这5种基因检测肺炎链球菌的敏感性和特异性.结果 5种引物均具有较好的检测灵敏度,扩增效率均高于90%.5种引物的Ct值变化均在0.5以内,在PCR扩增时具有可靠的稳定性.利用这5种引物对37株肺炎链球菌和28株非肺炎链球菌进行荧光定量PCR检测,lytA 、ply和spn9802特异性较强(检出阳性率和检出阴性率均为100%).但是lytA 、ply的检测下限较spn9802高一个数量级(101CFU/ml比102 CFU/ml).saA和cspA特异性较弱[psaA检出阴性率为89%(25/28),cspA检出阳性率为97%(36/37)].对80例临床痰液标本进行检测表明,荧光定量PCR在检测特异性上明显优于传统培养法.5种引物在检测临床痰液标本中存在差异,lytA和ply显示出较好的检出率[阳性率分别为92.50%(74/80)、90.00%(72/80)],spn9802次之[86.25%(69/80)],psaA和cspA特异性最弱[76.25%(61/80)和78.75%(63/80)].结论 临床常用的5种荧光定量PCR基因在检测肺炎链球菌感染中的特异性和敏感性各不相同,lytA和ply特异性最强,spn9802次之,psaA和csPA特异性最弱。

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