数字经济有效地推动了我国经济发展，但数字经济在地区间的发展并不均衡，对地区间企业所得税分配格局造成了冲击。基于2008—2019年我国省级制造业企业所得税面板数据，考察数字经济对地区间企业所得税分配格局的影响。实证研究表明，现行地区间企业所得税分配规则下，数字经济发展使得少数地区企业所得税分配受益，而多数地区受损。异质性分析表明，现行分配规则不利于中、高财政压力地区的企业所得税收入形成，增加了这些地区企业所得税转出的可能性，加深了这些地区企业所得税转出的程度。因此，为更好地应对数字经济对地区间企业所得税分配的冲击，以实现地区间企业所得税分配与数字经济发展的良性循环，在未来的地区间企业所得税地方分享部分，应采用消费地原则三因素法进行分配，或者采用生产地原则三因素法辅之以基于各地消费贡献的财政分配方式。