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农业动物种质资源面临着严重危机，有必要构建一个科学、有效的保护方案，合理分配有限的资金，以期保护最大的多样性。本文应用边际多样性方法，以中国18个地方猪种为例，通过对灭绝概率、现实多样性、边际多样性和保护潜力的分析，应用3种模型分析了未来群体期望多样性变化趋势，并提出了相应的资金优化配置方案。在文中所涉及的模型中，加性模型（Model A）被评定为资金优化配置的最佳模型；共有10个品种获得保护资金，其中杭猪获得最高比例（16％）的保护资金；其次为赣中南花猪（万安猪）、嵊县花猪，各获得14％；阳新猪、乐平猪