【摘 要】
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应用in silico的方法，利用Blastn和Blastx搜索引擎，将鲤鱼微卫星序列与GenBank数据库进行同源序列比对。利用Blastn，将侧翼序列长度〉50bp的875个鲤鱼微卫星序列与斑马鱼的EST数
【机 构】
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中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,中山大学生命科学学院
【基金项目】
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Supported by National Basic Research Program of China （2004CB117405） Acknowledgements The authors thank Dr. ZHOU Yi for re-editing the English language of this manuscript
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应用in silico的方法，利用Blastn和Blastx搜索引擎，将鲤鱼微卫星序列与GenBank数据库进行同源序列比对。利用Blastn，将侧翼序列长度〉50bp的875个鲤鱼微卫星序列与斑马鱼的EST数据库首先进行比对，结果找到了121个同源序列。随后采用Blastx搜索蛋白质数据库，有94个微卫星位点存在同源蛋白。除了33个假定和3个未知蛋白外，剩余的58个微卫星位点被成功地进行了功能注释，而且其中的7个位点已经定位在了鲤鱼连锁图谱上。另外，通过PCR．SSCP的方法，将两个与鲤鱼微卫星侧翼序列
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