2013–2014年宁夏回族自治区柯萨奇病毒A10型分离株VP1区基因特征

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目的

分析宁夏回族自治区(宁夏)手足口病病例中柯萨奇病毒A10型(CV-A10)分离株的基因特征。

方法

于2013年1月–2014年12月,利用手足口病实验室网络监测系统,采集宁夏各市、县到当地人民医院就诊的手足口病病例标本,共采集2 470份,其中粪便标本450份,咽拭子2 020份。使用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离,获得的各种毒株用兼并引物进行VP1区基因扩增和序列测定。测序结果利用Blast进行病毒型别鉴定后,对鉴定为CV-A10的所有毒株进行同源性和系统进化分析。

结果

共收集到非EV-A71和非CV-A16的肠道病毒标本450份,分离到CV-A10 36株,其中,2013年6株,2014年30株。36株毒株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为90.6%~100.0%和90.2%~100.0%。与A、B、C、D各型别代表株的同源性比较发现,36株毒株与C型代表株的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为90.2%~98.9%和95.7%~99.7%。系统进化分析显示,36株宁夏CV-A10分离株与C基因型代表株处于同一分支。

结论

CV-A10是引起宁夏地区手足口病的常见病原体,本次分离到的CV-A10均属于C基因型,具有较宽的同源性范围。

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