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以我国苹果生产主要使用的5个M、MM系矮化砧木基因型为试材,建立了AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)分析技术体系。从42对AFLP引物中筛选出了5对多态性高、分辨能力强的引物(即P44M64、P50M41、P66M53、P69M46和P81M65)。依据引物P44M64构建的指纹图谱,区分了供试的5个矮化砧木基因型。根据13对AFLP引物的扩增