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将在线小波变换用于毛细管电泳信号的滤噪处理,满足了毛细管电泳信号采集过程中实时处理和监控的需求.针对毛细管电泳信号的特点,采用固定时间窗的在线小波变换,并给出最佳时间窗长的选择方法.模拟信号和冬虫夏草的毛细管电泳信号滤噪实验的结果表明,该方法在保持峰位与峰高不变的情况下可显著提高信噪比,有效滤除了噪声峰.