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用透明骨骼标本染色法制作变色树蜥的骨骼标本，并对其骨骼系统进行了全面的描述。其骨骼可分为中轴骨骼（包括头骨、脊柱、胸骨、肋骨）和附肢骨骼（包括肩带、腰带、前肢骨、后肢骨）。其头骨呈梨形，眼眶完整。颈椎8枚，胸椎4枚，腰椎11枚，荐椎2枚，尾椎多于34枚。有颈肋4对，胸肋4对，腰肋11对。表现出了一系列进化特征，如前颌骨愈合成1块，额骨也愈合成1块，颧骨消失，鳞骨变小，犁骨薄弱，下颌夹板骨与齿骨、冠状骨及隅骨之间的骨缝不明显，愈合程度较高。