异基因造血细胞移植（allogeneic hematopoietic cell transplantation, allo-HCT）是治疗恶性血液病和一些非血液系统疾病的重要方法，而急性移植物抗宿主病（acute graft-versus-host disease, aGVHD）作为allo-HCT后的主要并发症，严重影响移植疗效，是导致移植失败和非复发死亡的主要原因。间充质干细胞（mesenchymal stem cells, MSCs）因具有独特的组织修复及免疫调节功能，在aGVHD的防治中显示出巨大的应用前景。然而，目前MSCs在临床试验中的发现大大超过了对其生理性质和功能的基础研究，而且对MSCs免疫调节机制方面认识的不足和监测其在临床适应证中治疗反应性的特异性标志分子缺乏，一定程度上限制了MSCs的临床应用转化。本文主要就aGVHD的病理生理过程、MSCs的功能特点及其在aGVHD中发挥免疫抑制作用的机制和监测MSCs反应性的生物标志物等内容进行综述，探讨MSCs在临床应用中的局限性及可行性。