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省部合作是国家与地方在推进经济社会发展中形成的创造性举措,也是国家与地方合力推进区域经济发展新的互动机制。在分析海西建设中省部合作发展现状与存在问题的基础上,围绕自主创新、两岸合作、城乡统筹等关键问题,探讨了推进省部合作的主要任务,提出要通过加强组织领导、拓宽和优化合作领域、健全合作机制、创新合作形式等方式推进省部合作,加快海峡西岸经济区建设。