【摘 要】
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在高维的基因表达谱数据中,只有少量基因对分类诊断其作用,而且还存在大量冗余的与癌症分类诊断无关的噪声基因,这些都会导致分类性能的下降.通过基因选择选取与分类紧密关联
【机 构】
:
中国计量学院机电工程学院,中国计量学院信息科学学院
【基金项目】
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国家自然基金(60905034,61272315)资助项目;浙江省自然基金(Y1080950,1110342)资助项目
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在高维的基因表达谱数据中,只有少量基因对分类诊断其作用,而且还存在大量冗余的与癌症分类诊断无关的噪声基因,这些都会导致分类性能的下降.通过基因选择选取与分类紧密关联的基因,不仅能够剔除与疾病无关的基因,减少机器学习算法的时间复杂度和空间复杂度,提高分类的正确率,而且选出的特征基因可以作为肿瘤基因诊断和肿瘤药物治疗靶标确定的依据,降低后期生物学分析成本.本文提出一种基于聚类和粒子群算法(Particle swarm optimization,PSO)的基因选择方法,在PSO算法进行搜索之前,先对基因进行聚类
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