目的：针对腹腔镜在卵巢囊肿手术中的应用效果进行分析研究。方法：随机选择2013年12月-2015年2月期间，在我院进行卵巢囊肿手术的患者120例，作为本次研究的对象，将其平均分为对照组和观察组，对照组实施传统的开腹手术，观察组实施腹腔镜手术，针对两组患者的临床手术情况、不良反应等指标进行观察比较。结果：在本次研究中，观察组患者的手术时间、术中出血量、排气时间、住院时间与对照组比较，均有显著性差异，P＜0.05，具有统计学意义。且观察组与对照组患者治疗中不良反应的发生率分别为1.67%、15.00%，经统计学比较，P＜0.05，具有统计学意义。结论：在卵巢囊肿治疗的过程中，实施腹腔镜手术治疗，可以减少术中的出血量，缩短手术时间，减少对患者产生的伤害，减少术后不良反应和并发症的产生，安全性和有效性较高，可以将其进行推广应用。