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目的从四川省巴中市采集的蚊虫标本中分离乙型脑炎（简称乙脑）病毒（JEV），确定其基因型别，并分析相关的基因1型乙脑病毒PrM和E基因区段氨基酸序列特征。方法对2004年采集蚊虫标本进行病毒分离，对新分离的乙脑病毒进行生物学、血清学及分子生物学鉴定。逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）扩增新分离JEV的PrM、E区段核苷酸序列，测序后应用ClustalX软件做碱基配对分析，MEGA4软件完成病毒进化分析，GENEDOC（3．2）软件完成氨基酸位点分析，根据蜱传脑炎病毒可溶性蛋白晶体结构为模板进行乙脑病毒E蛋白