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文章针对新建本科院校教学运行机制存在的两个"路径依赖",分析了新建本科院校教学运行机制构建和创新面临的挑战,提出新建本科院校教学运行机制的构建必须针对自身特点及面临的挑战,创新教育管理思想.实现管理体系由专科封闭武向本科开放式转变,管理机制由约束型向激励型转变,管理方式由过程型向目标型转变.重点优化教学管理组织和制度两大系统.