在章太炎众多弟子中，普通读者最为熟悉的自然是鲁迅，然后大概是周作人、钱玄同和黄侃。其实，如果说到纯粹学术上的传承，则章太炎最为看重的是黄侃。相对于这几位同门，朱希祖则较少为人所知，虽然他是二十世纪著名的史学家，是中国史学会的发起者。章氏有所谓“五大天王”的戏谑之语，后又封西王朱希祖。虽为玩笑，即天王黄侃、东王汪东、北王吴承仕、翼王钱玄同，却反映出他心目中对其弟子的看法。而朱希祖本人，对于这“四大”或“五大”天王的说法也很看重，在其日记中专门有记载并评价说：“黄、钱、汪皆传师之文字学，吴传经学，称为‘四子’较是。……余则独治史学，非传自师，应不在‘四子’之列。余之治文字学、经学，皆以史学治之，与师法皆异，其不列入‘四子’甚是。”（见其1939年12月7日日记）。章太炎在其《自撰年谱》中虽未用“四大天王”的说法，却从学术上对朱希祖给予特别肯定：“弟子成就者，蓟黄侃季刚，归安钱夏季中，海盐朱希祖逖先。季刚、季中皆明小学，季刚尤善音韵文辞。逖先博览，能知条理。其他修士甚众，不备书也。”当章氏撰此年谱之时，汪东已入章门，但章太炎并未將其列入，而吴承仕入门更晚，自然也属于“不备书”之列。众多弟子中章氏仅仅评说了三个人，而朱希祖就名列其中，无怪乎他在此日日记中发出“余对先师终有知己之感”这样的感叹了。
　　也因此，朱希祖日记中有很多对章太炎言行的记录和评价。中华书局所出版之《朱希祖日记》（上中下三册）始于1906年，也是在这一年，日记中开始出现与章太炎有关的信息。这年12月2日，有“至神田锦辉馆观章炳麟及孙文演说”一句。文字虽然简略，却很有意味，首先对其演说不是用“听”而是“观”，有既听演讲又要看人之意，与当今之追“星”类似。其次将章太炎置于孙中山之前，其顺序排列当看出他们二人在中国留学生心目中的地位。
　　由于缺少1907年的日记，有关朱希祖与章太炎进一步交往信息出现在朱希祖1908年日记中。该年三月朱希祖听章太炎、刘师培等讲演，并记下自己听后的想法。而到这一年的4月4日，已经有“下午，至清风亭请章先生讲《段注说文》”的文字，而且朱希祖在听后也开始按照章太炎的观点“立古音二十二部表目录”了。此后数日，朱希祖再次“至帝国教育会听章太炎讲《说文序》”。这并不是指当年在东京与鲁迅、周作人、钱玄同等七人一起听章太炎讲课一事，那要等到这一年的7月11日。不过，由此开始朱希祖与章太炎长达数十年的师生关系，应该是确定无疑了。
　　现存朱希祖日记中，有关章太炎的记录很多，其中较重要者有1913年朱希祖与鲁迅、许寿裳等提议注音字母一事，当年1月，教育部在北京召集国语读音统一会，朱希祖奉派出席。会议代表们审核音素、采定字母时众说纷纭，久争不决。朱希祖主张以章太炎所定的采古文纂籀经省之形为字母；既采其形，复符本音；凡声母四十二，韵母十二，介母三，名为“注音字母”。代表们讲过激烈讨论，最终决议通过。朱希祖遂名动京师，北京大学马上聘为预科教员，并兼清史馆编纂。朱希祖对此极为自得，在日记中写下“从此简字不能通行于中国，希祖与有微力也”之自我表扬之句。此时章太炎正在东北任袁世凯政府东三省筹边使，闻之此事也极为高兴，给朱希祖写信大加称赞，自然也被朱希祖纳入日记之中：“闻以读音统一会事入京，果为吾道张目，不胜欣躍。”
　　1936年6月，章太炎去世，此事自然对朱希祖刺激甚大，在其日记中也多有文字记叙，从中不难看出朱希祖的悲痛以及与章太炎的深厚师生之情。当时朱希祖正在南京中央大学任教，而章太炎住在苏州，所以朱希祖常去看望章氏并在章氏所办之国学讲习会讲课。该年6月5日晚，朱希祖到苏州，“至章宅适太炎师病，造卧室问安，即睡”。一个“适”字，说明朱希祖事先并未获知章氏患病，而次日朱希祖按计划讲课并和“师母汤夫人”等一起外出游览，也说明章氏病情并不严重。事实上，朱希祖6月7日再次冒雨外出游览太湖，并且是和六十位国学讲习会学员一起同游，晚上又和章氏一起吃饭，也说明章氏病情不重，或者并未引起重视。但等到6月9日朱希祖离开苏州之前与章氏闲谈时，则已注意到“先生面色瘦削而惨白，病容颇深，……午后二时，辞先生回京，先生因病倚沙发而坐，临行先生尚起立而送”。显然，章太炎的病情正在加重，但既然还可以“起立而送”，朱希祖也就无论如何不会想到，仅仅四天之后就收到章太炎去世的消息吧。6月14日这一天，朱希祖上午先是到内政部开会，下午四时散会后又去参观文物展览。“六时回寓，接苏州章宅来电，报告吾师太炎先生于十三日上午八时逝世”。朱希祖的震惊和悲痛可以想见：“呜呼！相违五日，竟尔永诀，悲哉！”不过朱希祖虽然悲痛至深，并未影响其学术研究，当日晚他依然继续“抄《西魏赐姓考》”，为撰写反驳陈寅恪有关李唐统治集团可能有胡人血统之说的论文作准备。有关这方面具体情况，笔者另有文详述，不赘。
　　当然，章氏既然去世，朱希祖必然会尽弟子的职责。一方面，他赶去苏州吊唁。6月15日他乘火车到苏州，随即参与吊唁及处理章氏后事活动。一方面，他撰写了悼念其师的挽联：
　　一代通儒尊绛帐，千秋大业比青田
　　上联“绛帐”典出《后汉书·马融传》：“融才高博洽，为世通儒，教养诸生，常有千数……居宇器服，多存侈饰。常坐高堂，施绛纱帐，前授生徒，后列女乐，弟子以次相传，鲜有入其室者。”后世遂以“绛帐”为师门、讲席的敬称。下联以“青田”代指明朝开国元勋刘基，而章太炎平生最倾慕之人正是刘基，章氏甚至想死后葬于刘基墓旁，为此还曾写信给刘氏后人。所以朱希祖将章氏与刘基相提并论，自然极为贴切。
　　有关章太炎去世这几日朱希祖的活动内容，日记中所录甚多，其中引起笔者注意的有这样几件事情。一个是同门马宗霍所提及的章太炎对曾国藩、王闿运和章氏自己文章的评价：“王闿运文长于雅。曾国藩文长于俗（俗，非俚俗之俗，乃指能记载人事），余在雅俗之间。”王闿运之“雅”，从其诗可以观之。民初汪国垣作《光宣诗坛点将录》列他为诗坛头领，冠于一代诗人之首也是明证。至于文，其他不必说，单由其撰《湘军志》即可看出其“雅”。不过，说曾国藩文为“俗”，则是章氏的高明之处，因他看出曾国藩文不尽空谈而能有对世俗人事的记录，实为难得。至于章氏以“雅俗之间”评定他自己的文章，虽为自负之语，倒也大致不差。