【摘 要】
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目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)在食管鳞状细胞癌(ESCC)患者外周血中的表达及意义。方法收集南京市第一医院2015年6月至2018年12月期间早期(Ⅰ～Ⅱ)ESCC患者(组别1)、中晚期(Ⅲ～Ⅳ)ESCC患者(组别2)、正常成人(对照组)血清标本各5例，采用TRIzol试剂提取总RNA，将转录得到的cRNA为模板反转录合成cDNA，纯化后荧光标记并与lncRNA芯片进行杂交。两两比较筛选
【机 构】
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江苏省肿瘤医院 江苏省肿瘤防治研究所 南京医科大学附属肿瘤医院普外科 210009,南京市第一医院 南京医科大学附属南京医院肿瘤外科 210006,南京市第一医院 南京医科大学附属南京医院肿瘤外科 2
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目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)在食管鳞状细胞癌(ESCC)患者外周血中的表达及意义。
方法收集南京市第一医院2015年6月至2018年12月期间早期(Ⅰ～Ⅱ)ESCC患者(组别1)、中晚期(Ⅲ～Ⅳ)ESCC患者(组别2)、正常成人(对照组)血清标本各5例，采用TRIzol试剂提取总RNA，将转录得到的cRNA为模板反转录合成cDNA，纯化后荧光标记并与lncRNA芯片进行杂交。两两比较筛选出相对表达量比值在2倍以上且差异有统计学意义的lncRNA作为差异表达的lncRNA。应用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)验证lnc_TCONS_00011689在ESCC样本中的表达情况，并分析其与ESCC患者临床病理特征及预后的关系，随访日期截止2019年12月31日。应用GraphPad Prism 5.0统计学软件分析，采用配对t检验和Log-rank生存分析。
结果在组别1比对照组中上调的lncRNA有1 620条，下调的lncRNA有102条。在组别2比对照组中上调的lncRNA有17条，下调的lncRNA有129条。在组别2比组别1中上调的lncRNA有9条，下调的lncRNA有73条。生信数据分析显示这些差异表达基因的功能与细胞间相互作用、代谢、免疫应答、细胞黏附分子等功能均具有显著相关(r>0.99，P<0.05)。不同组别差异表达的lncRNA与差异表达的mRNA共表达分析显示表达结果中关联度最大的前1 000个关系对(r>0.99，P<0.05)。lnc_TCONS_00011689在ESCC患者血浆中表达与正常人比较明显降低，其在ESCC患者血浆中的表达为5.12±0.31，在正常人血浆中的表达为4.03±0.26，差异有统计学意义(t＝2.187, P<0.05)。lnc_TCONS_00011689与ESCC临床TNM分期呈负相关(t＝2.716，P<0.05)，而与年龄、性别、分化程度以及淋巴结转移均无明显相关(P>0.05)。随访结果显示lnc_TCONS_00011689表达低的ESCC患者总生存期相比于高表达的患者更短(F＝0.048，P<0.05)。
结论建立不同分期的ESCC患者外周血中差异lncRNA表达谱。lnc_TCONS_00011689可作为食管鳞癌诊断、分期及预后监测的血浆分子标志物。
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