【摘 要】
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利用MISA软件对毛红椿28 725条Unigene序列进行SSR位点检测，在10 764条Unigene序列中检测出14 106个SSR位点，SSR发生频率为37.47%，平均每5.18 kb出现一个SSR位点。优势重复基元以单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复为主，分别占比为56.64%、20.91%、19.62%。SSR位点核苷酸重复基元类型共有215种，主要以单核苷酸重复类型A/T为主，占总S
【机 构】
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江西农业大学林学院江西省森林培育重点实验室江西特色林木资源培育与利用2011协同创新中心
【基金项目】
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国家自然科学基金（31860202; 32101515）资助；
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利用MISA软件对毛红椿28 725条Unigene序列进行SSR位点检测，在10 764条Unigene序列中检测出14 106个SSR位点，SSR发生频率为37.47%，平均每5.18 kb出现一个SSR位点。优势重复基元以单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复为主，分别占比为56.64%、20.91%、19.62%。SSR位点核苷酸重复基元类型共有215种，主要以单核苷酸重复类型A/T为主，占总SSR数量的55.54%；SSR重复类型以9～12重复次数最多，占总数的48.00%。用Primer 3软件对含有SSR位点的序列进行批量设计引物，合成320对SSR引物，获得7对多态性引物，在20个样品中进行毛细管电泳检测，共检测到26个等位基因，平均等位基因数为3.71个，平均有效等位基因数为2.06个，平均Shannon多样性指数（I）为0.8 523，平均多态性信息含量（PIC）为0.4 344，其中MC85、TM121和TM96为高度多态性位点（PIC＞0.5）。结果表明基于毛红椿转录组序列开发的SSR引物可用于毛红椿种群遗传多样性研究，为毛红椿遗传背景研究奠定基础。
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