大多数疫苗的注射都属于肌肉注射，即需要注射在人体肌肉里。只有少数是例外，如轮状病毒疫苗是口服的，还有一些疫苗是皮下注射的，如麻疹疫苗、腮腺炎疫苗和风疹疫苗等。
　　那么，为什么大多数疫苗要选择肌肉注射呢？
　　首先，因为肌肉组织里含有重要的免疫细胞。这些细胞能识别出抗原，也就是疫苗携带的会激发免疫反应的一小块病毒或细菌。以新冠肺炎疫苗来说，其中携带的并非是一种抗原，而是赋予了制造抗原所需的图纸。肌肉组织中的免疫细胞会抱起这些抗原，然后帶给淋巴结。将疫苗注射进肌肉组织，能够使疫苗维持在一个小范围的区域内，这样免疫细胞就会向其他的免疫细胞发出警报，让它们也过来干活。
　　一旦肌肉中的免疫细胞识别出疫苗，它们便会带着抗原来到淋巴管，淋巴管负责将携带抗原的免疫细胞运送至淋巴结中。淋巴结是免疫系统的关键结构，其中有更多能识别出疫苗抗原的免疫细胞，然后会启动制造抗体的免疫进程。
　　淋巴结的作用如此重要，淋巴结附近的肌肉便成为疫苗接种的黄金点。人体有两个黄金点：一个是胳膊上臂的三角肌，这里靠近腋下的淋巴结;另一个是大腿上的肌肉区，这里靠近腹股沟的淋巴结。
　　其次，肌肉组织容易将疫苗反应局域化，使得人体的疫苗接种即使出现反应也只会造成局部发炎，或者在接种点附近出现酸痛，而这个结果绝大多数人都可以靠自身免疫力消除。如果疫苗注射进了脂肪组织里，刺激和炎症反应的概率就会增加，因为脂肪组织的供血很差，导致一些疫苗成分难以吸收。
　　在人体的两个黄金点上，肌肉注射还要考虑肌肉的大小。成人和三岁及以上儿童的接种点位通常是上臂处的三角肌。更年幼的孩子，通常要在大腿接种，因为他们的手臂肌肉太小，三角肌发育还没有形成。