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目的 评价复式PCR在闽南疟疾监测中的应用效果。方法采集流行区发热病人及疫点居民血样用复式PCR一次扩增同时检测恶性疟原虫(P.f)和间日疟原虫(P.v)。结果249例发热病人PCR测阳性率为8.02%,敏感性为100%,特异性99.56%符合率99.59%,镜检阳性率为7.63%,抽查疫点居民701人检测疟原虫,未发现阳性样本,复式PCR检测大批样本平均费用不高于传统镜检方法。结论该复式PCR检测系统用于闽南现场疟疾监测具有敏感、特异、快速等特点,可用于分子流行病学调查、防治效果考核及虫种鉴别等。