前列腺癌差异性下调lncRNA的数据挖掘及表达分析

来源 :牡丹江医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:george_zg
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目的筛选前列腺癌中差异性下调的lncRNA。方法从TCGA数据库获取前列腺癌和癌旁组织的基因表达数据;利用R语言中EdgeR程序包筛选前列腺癌中表达下调的lncRNA;分析排名最靠前的lncRNA在前列腺癌不同种族、年龄、Gleason评分的临床样本中的差异表达;GraphPad Prism绘制ROC曲线;KEGG分析获取相关信号转导通路。结果筛选出前列腺癌组织中显著下调的lncRNA166种,其中EMX2OS排名最靠前;EMX2OS能够区分前列腺癌组织与癌旁组织;不同种族、不同Gleason评分、不同年
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