建兰胶孢炭疽菌ITS序列分析及其PCR快速检测

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由胶孢炭疽菌Colletotrichum gloeosporioides引起的炭疽病是建兰的重要病害。为建立快速检测该病原菌的方法,以ITS1/ITS4为引物,对15个建兰胶孢炭疽菌的ITS进行PCR扩增及测序,将测定的序列与炭疽菌属其它种的ITS序列进行比对分析,设计特异性引物CF1/CR1,并通过常规和巢式PCR对建兰胶孢炭疽菌进行检测。结果显示,15个菌株中有13个菌株ITS序列与该菌的模式种序列相似性高达99%以上,而另外2个菌株相似性则为86%;供试菌株在系统发育树上聚为2个不同的分支;引物CF1/CR1通过常规PCR可从1 ng的建兰胶孢炭疽菌基因组DNA中扩增到目的条带,而利用引物ITS1/ITS4和CF1/CR1通过巢式PCR可从1 pg的基因组DNA中扩增到目的条带,即巢式PCR反应检测灵敏度较常规PCR至少高1000倍。研究表明建立的巢式PCR法可从自然感病的建兰叶片组织中检测到胶孢炭疽菌。
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