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目的
鉴定新的参与奈美亨综合征(NBS)小鼠模型中与小脑发育缺陷相关的长链非编码RNA(lncRNA),并探讨其与小脑增殖分化相关的功能。
方法利用芯片技术分析野生型(野生组,Nbs1CNS-ctr)小鼠及Nbs1神经元特异性敲除(突变组,Nbs1CNS-del)小鼠小脑中RNA的表达差异;利用即时荧光定量PCR技术对芯片结果加以验证;针对目的RNA,检测其全身表达及小脑中表达模式、细胞内定位以及对母基因的表达调控模式。
结果lncRNA Gm15577是由神经生长调节因子-1(Negr1)基因内部的内含子区反向转录而成,特异性表达于小脑,且在其发育过程中呈动态变化趋势,而Nbs1缺失之后整体表达水平显著降低;同时,与未分化期比较,分化后的小鼠小脑原代神经前体细胞中Gm15577及其母基因Negr1均有显著升高;Gm15577敲低之后导致Negr1以及小脑增殖分化相关因子Shh与β-catenin在RNA水平的表达显著下调;人髓母细胞瘤临床样本数据分析表明Negr1基因在正常人群与肿瘤患者之间有显著的表达差异。
结论从神经特异性敲除Nbs1小鼠模型出发报道了一个新的与小鼠小脑发育相关的lncRNA Gm15577,初步结果表明Gm15577通过调控Negr1进而影响小脑神经元增殖与分化进程中的Shh与β-catenin信号通路,其基因行为异常有可能与髓母细胞瘤发病有一定的相关性。