肿瘤突变负荷检测一致性评价

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目的使用肿瘤突变负荷(TMB)检测国家参考品,评价基于高通量测序法的肿瘤突变负荷检测试剂盒的TMB检测一致性。方法使用TMB检测试剂盒(可逆末端终止测序法)检测肿瘤突变负荷检测国家参考品中11对来自肿瘤组织永生化的细胞系和配对白细胞永生化的细胞系。首先将DNA打断,进行末端修复、加接头和PCR扩增等步骤后构建文库;然后将文库杂交捕获;最后使用Next⁃Seq550 Dx测序仪进行测序。结果经试剂盒检测,得到TMB⁃1%、TMB⁃2%、TMB⁃5%和TMB⁃10%的TMB检测国家参考品的Panel⁃TMB值
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